Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms