Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21866J3QMH4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21866J3QMH4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms