Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pira2F8VQ94 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pira2F8VQ94 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms