Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Pira2F8VQ94 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Pira2F8VQ94 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Pira2F8VQ94 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Pira2F8VQ94 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Pira2F8VQ94 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Pira2F8VQ94 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pira2F8VQ94 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Pira2F8VQ94 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Pira2F8VQ94 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Pira2F8VQ94 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pira2F8VQ94 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Pira2F8VQ94 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pira2F8VQ94 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
Pira2F8VQ94 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Pira2F8VQ94 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pira2F8VQ94 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Pira2F8VQ94 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pira2F8VQ94 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pira2F8VQ94 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pira2F8VQ94 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Pira2F8VQ94 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pira2F8VQ94 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pira2F8VQ94 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pira2F8VQ94 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pira2F8VQ94 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Pira2F8VQ94 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Pira2F8VQ94 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pira2F8VQ94 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Pira2F8VQ94 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Pira2F8VQ94 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Pira2F8VQ94 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Pira2F8VQ94 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Pira2F8VQ94 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Pira2F8VQ94 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Pira2F8VQ94 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Pira2F8VQ94 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Pira2F8VQ94 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Pira2F8VQ94 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Pira2F8VQ94 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Pira2F8VQ94 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Pira2F8VQ94 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pira2F8VQ94 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Pira2F8VQ94 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Pira2F8VQ94 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Pira2F8VQ94 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Pira2F8VQ94 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Pira2F8VQ94 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Pira2F8VQ94 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Pira2F8VQ94 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Pira2F8VQ94 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Pira2F8VQ94 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Pira2F8VQ94 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Pira2F8VQ94 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Pira2F8VQ94 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Pira2F8VQ94 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Pira2F8VQ94 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Pira2F8VQ94 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Pira2F8VQ94 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Pira2F8VQ94 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Pira2F8VQ94 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Pira2F8VQ94 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Pira2F8VQ94 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Pira2F8VQ94 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Pira2F8VQ94 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pira2F8VQ94 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Pira2F8VQ94 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Pira2F8VQ94 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Pira2F8VQ94 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Pira2F8VQ94 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Pira2F8VQ94 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Pira2F8VQ94 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Pira2F8VQ94 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pira2F8VQ94 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Pira2F8VQ94 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Pira2F8VQ94 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Pira2F8VQ94 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Pira2F8VQ94 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Pira2F8VQ94 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Pira2F8VQ94 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Pira2F8VQ94 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Pira2F8VQ94 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Pira2F8VQ94 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Pira2F8VQ94 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Pira2F8VQ94 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Pira2F8VQ94 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Pira2F8VQ94 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Pira2F8VQ94 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Pira2F8VQ94 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Pira2F8VQ94 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Pira2F8VQ94 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Pira2F8VQ94 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Pira2F8VQ94 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Pira2F8VQ94 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Pira2F8VQ94 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Pira2F8VQ94 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Pira2F8VQ94 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Pira2F8VQ94 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Pira2F8VQ94 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Pira2F8VQ94 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms