Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa27F2Z403 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms