Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pi4kaE9Q3L2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms