Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42791D3YYB5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms