Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms