Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms