Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms