Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d3cQ9QZS8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms