Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms