Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms