Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms