Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpainQ9CWY9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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