Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MINDY3Q9CV28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms