Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole4Q9CQ36 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms