Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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GTF3C6Q969F1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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