Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk8Q8R3L8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk8Q8R3L8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms