Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms