Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CF25 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8CF25 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8CF25 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8CF25 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8CF25 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8CF25 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8CF25 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8CF25 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Q8CF25 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Q8CF25 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8CF25 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8CF25 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms