Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C3W1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C3W1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms