Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl42Q8BFQ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms