Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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NanogQ80Z64 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NanogQ80Z64 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NanogQ80Z64 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NanogQ80Z64 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NanogQ80Z64 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms