Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms