Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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