Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nphp3Q7TNH6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms