Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms