Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx5Q61686 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms