Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd53Q61451 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms