Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms