Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms