Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc106Q3ULM0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms