Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Fndc4Q3TR08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Fndc4Q3TR08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc4Q3TR08 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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