Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms