Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 GCN1YGL195W 8019 nt3.16□□□□□ -1.9
BUD20Q08004 VMR1YHL035C 4779 nt3.15□□□□□ -1.9
BUD20Q08004 MLH1YMR167W 2310 nt3.15□□□□□ -1.9
BUD20Q08004 PHO91YNR013C 2685 nt3.15□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.15□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 RPS22AYJL190C 393 nt3.15□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 FYV10YIL097W 1551 nt3.15□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 YPL150WYPL150W 2706 nt3.15□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 MGM1YOR211C 2646 nt3.15□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 GLC3YEL011W 2115 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 YDR521WYDR521W 336 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 PAU10YDR542W 363 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 PAU11YGL261C 363 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 PAU4YLR461W 363 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 ENV11YGR071C 2583 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 APL2YKL135C 2181 nt3.14□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 ALK1YGL021W 2283 nt3.13□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 NEW1YPL226W 3591 nt3.13□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 TAF2YCR042C 4224 nt3.12□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 NOP14YDL148C 2433 nt3.12□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 ENA5YDR038C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 ENA2YDR039C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 ENA1YDR040C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 MMS1YPR164W 4224 nt3.12□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 PSK1YAL017W 4071 nt3.11□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt3.11□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 BIR1YJR089W 2865 nt3.11□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 SWR1YDR334W 4545 nt3.1□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt3.1□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 DSE4YNR067C 3354 nt3.1□□□□□ -1.91
BUD20Q08004 BFR2YDR299W 1605 nt3.08□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 RPO41YFL036W 4056 nt3.08□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.08□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt3.08□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 NMD2YHR077C 3270 nt3.08□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 STE6YKL209C 3873 nt3.07□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 FLO5YHR211W 3228 nt3.07□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 UBP1YDL122W 2430 nt3.07□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 DRS2YAL026C 4068 nt3.07□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 UBP15YMR304W 3693 nt3.06□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 KAP120YPL125W 3099 nt3.06□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 COG6YNL041C 2520 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 CDC53YDL132W 2448 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 RGR1YLR071C 3249 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 RPL37BYDR500C 267 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 SQS1YNL224C 2304 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 MDM1YML104C 3384 nt3.05□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 SEC1YDR164C 2175 nt3.04□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.04□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.04□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 NFT1YKR103W 3657 nt3.04□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 CSR2YPR030W 3366 nt3.04□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 SDC25YLL016W 3147 nt3.03□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 TAH1YCR060W 336 nt3.03□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 YER078W-AYER078W-A 165 nt3.03□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.03□□□□□ -1.92
BUD20Q08004 snR64snR64 101 nt3.02□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt3.02□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt3.02□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 snR50snR50 90 nt3.02□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 ROM1YGR070W 3468 nt3.02□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt3.01□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 PKH2YOL100W 3246 nt3.01□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 MAK10YEL053C 2202 nt3.01□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YOR296WYOR296W 3870 nt3.01□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 ISW1YBR245C 3390 nt3.01□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 BUD4YJR092W 4344 nt3.01□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YGR067CYGR067C 2415 nt3□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 TFC4YGR047C 3078 nt3□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 ARO1YDR127W 4767 nt3□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 COG4YPR105C 2586 nt3□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YBT1YLL048C 4986 nt2.99□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 ECM21YBL101C 3354 nt2.98□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.98□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YSP2YDR326C 4317 nt2.98□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 YDR210WYDR210W 228 nt2.98□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 RPS26AYGL189C 360 nt2.98□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 MLH3YPL164C 2148 nt2.98□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 RGC1YPR115W 3252 nt2.97□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 POL2YNL262W 6669 nt2.97□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 SGM1YJR134C 2124 nt2.97□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 RTT107YHR154W 3213 nt2.97□□□□□ -1.93
BUD20Q08004 GLG1YKR058W 1851 nt2.96□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 BUB1YGR188C 3066 nt2.96□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 IST2YBR086C 2841 nt2.96□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 UFD2YDL190C 2886 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 FIR1YER032W 2631 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 EAF1YDR359C 2949 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 RPS28BYLR264W 204 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 SPO14YKR031C 5052 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 RPN1YHR027C 2982 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 YDL206WYDL206W 2289 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 MSB2YGR014W 3921 nt2.95□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 SMC6YLR383W 3345 nt2.94□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.94□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.94□□□□□ -1.94
BUD20Q08004 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.94□□□□□ -1.94
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