Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 NBL1YHR199C-A 222 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 PHS1YJL097W 654 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YNR025CYNR025C 360 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 EFR3YMR212C 2349 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 STO1YMR125W 2586 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 AIM9YER080W 1884 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 MMS4YBR098W 2076 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YJR003CYJR003C 1560 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 CYC7YEL039C 342 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YLR269CYLR269C 351 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 CMC4YMR194C-B 222 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 PRP16YKR086W 3216 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 LCD1YDR499W 2244 nt0.72□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 UTP20YBL004W 7482 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 PDE2YOR360C 1581 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YDL206WYDL206W 2289 nt0.71□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 ENV11YGR071C 2583 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 MYO1YHR023W 5787 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 NPC2YDL046W 522 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YML108WYML108W 318 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 RRT1YBL048W 312 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YDL073WYDL073W 2955 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YMR160WYMR160W 2451 nt0.7□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 SLI15YBR156C 2097 nt0.69□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.69□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 ZIP2YGL249W 2115 nt0.68□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YHR130CYHR130C 336 nt0.68□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 STE18YJR086W 333 nt0.68□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 ALY2YJL084C 3141 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YOR199WYOR199W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 SLD3YGL113W 2007 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 TIM13YGR181W 318 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 RPB10YOR210W 213 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM12Q04235 YHR125WYHR125W 306 nt0.65□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 NFU1YKL040C 771 nt0.65□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 WAR1YML076C 2835 nt0.65□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YKL202WYKL202W 582 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 AIM29YKR074W 468 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YBL071CYBL071C 309 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 CDC33YOL139C 642 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 IES4YOR189W 351 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YDL158CYDL158C 309 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 GPG1YGL121C 381 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YLR287CYLR287C 1068 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 ZEO1YOL109W 342 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YPR153WYPR153W 423 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YDL196WYDL196W 330 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 ALG13YGL047W 609 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 snR54snR54 86 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 GEA2YEL022W 4380 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 PKH2YOL100W 3246 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YJL135WYJL135W 318 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 DBP6YNR038W 1890 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YDL011CYDL011C 324 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 BI2Q0110 1272 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 ECL1YGR146C 636 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 QCR9YGR183C 201 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YGR290WYGR290W 444 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM12Q04235 RKR1YMR247C 4689 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YCK3YER123W 1575 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 ISD11YER048W-A 285 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 PAU12YGR294W 363 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YNL122CYNL122C 348 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 SWF1YDR126W 1011 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YGR042WYGR042W 816 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 YOL160WYOL160W 342 nt0.57□□□□□ -2.32
TRM12Q04235 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
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