Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb1Q00420 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabpb1Q00420 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms