Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1bP97952 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms