Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt4P40749 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt4P40749 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt4P40749 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms