Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A1P19634 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms