Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NefhP19246 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NefhP19246 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NefhP19246 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NefhP19246 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NefhP19246 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NefhP19246 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NefhP19246 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NefhP19246 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms