Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fv4P11370 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms