Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PomcP01193 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PomcP01193 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PomcP01193 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PomcP01193 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PomcP01193 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PomcP01193 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PomcP01193 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PomcP01193 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PomcP01193 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PomcP01193 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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