Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn1O35350 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms