Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ptpn9O35239 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ptpn9O35239 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ptpn9O35239 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ptpn9O35239 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ptpn9O35239 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ptpn9O35239 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ptpn9O35239 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ptpn9O35239 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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