Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnk3O35111 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms