Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm7980L7N471 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7980L7N471 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7980L7N471 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7980L7N471 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7980L7N471 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7980L7N471 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm7980L7N471 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm7980L7N471 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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