Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer2J3QPU5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms