Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Abcc8B2RUS7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms